宇宙の未来を託された一人の少年、彼を執拗に恐るべき暗殺者が追跡する。そして宇宙最強の支配者メンシュハイトの正体とは？戦慄の事実が明らかになる時、宇宙の正義を守るため立ち上がったウルトラマンネオスに、今最大の危機が襲いかかる！
