鴨居商店の山崎工場が完成し、マッサン（玉山鉄二）とエリー（シャーロット）のもとに娘のエマ（住田萌乃）が来て四年が経ち、エリーは妻として、そして母として毎日奮闘していた。一方、マッサンはヨーロッパ留学から帰国した英一郎（浅香航大）や俊夫（八嶋智人）らと原酒づくりに取り組んでいた。しかし、鴨居商店の経営状況は予想以上に悪化しすぐにウイスキーを出荷するか製造中止にすべきとの声が社内からあがって…。
